GNU R Shell Scripts

为了能发挥bash的力量，R脚本最好能戴上参数，这样就能批处理很多数据了。
试验一：
=====
以下文件存为 test.r：

args = commandArgs()
print(args)
q()

运行：

R --slave --args test1 test2=no < test.r

输出：

[1] "/usr/lib64/R/bin/exec/R"
[2] "--slave"
[3] "--args"
[4] "test1"
[5] "test2=no"

如果把test.r脚本中的

args = commandArgs()

改为：

args = commandArgs(TRUE)

那就只会输出自定义的参数：

[1]　"test1"  "test2=no"

这种代码威力还不够，

试验二：
=====
以下文件存为 testrun.r：

#!/usr/bin/env Rscript
args <- commandArgs(TRUE)
print(args)

然后chmod
chmod +x testrun.r

这样运行起来，参数的输入就漂亮多了：

testrun.r　test1 test2=no

结果：

[1]　"test1"  "test2=no"

试验三：
把以下文件存为：　test.sh

#! /bin/bash
for csv in `ls *.csv`
do
testrun.r $csv
done
exit

运行
sh test.sh
这样就可以以csv文件名作参数，传递给testrun.r

简洁的想法